Des problèmes spécifiques liés à l’élevage sont mis en évidence : maîtrise du parasitisme, coût de la finition des animaux et difficultés d’approvisionnement en concentrés BIO, ainsi qu’en engrais, semences, minéraux... L’absence de structuration de l’aval aboutit soit à une absence de valorisation en BIO soit à un excès de temps passé et de risques liés au commercial. L’indispensable autonomie fourragère (coût des fourrages) oblige à sécuriser les systèmes fourragers par un faible niveau de chargement. Les résultats économiques souffrent d’une valorisation aléatoire des produits et de la faiblesse des structures.